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摘要
以45株食源性沙门氏菌喹诺酮耐药株为对象，采取全基因组测序和实时聚合酶链式反应（real-time polymerase chain reaction,real-time PCR）法检测parC、gyrA基因突变位点，并对检测方法可靠性、耐药基因突变特征进行评估和分析。首先将4株沙门氏菌进行二代全基因组测序，根据测序数据分析结果，建立了一种real-time PCR法检测gyrA Asp87Tyr、gyrA Asp87Asn、parC Thr57Ser和parC Ser80Ile这4个突变位点。将沙门氏菌进行qnrS、qnrA、qnrB的real-time PCR检测，发现有31株菌未检出qnr基因。以这31株菌为对象，采取real-time PCR法筛查基因突变位点，结果发现parC Thr57Ser和gyrA Asp87Asn型突变最常见。将real-time PCR阳性的10株菌扩增parC、gyrA基因全长并测序，real-time PCR检测和测序结果完全吻合，说明了real-time PCR检测的可靠性。全基因组测序和real-time PCR法相结合的方法用于耐药基因突变筛查，既可以发现新的基因突变，又可以快速筛查大样本的主要突变类型，可作为沙门氏菌耐药性研究的一种可靠手段。
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