基于线粒体基因组的鲹科鱼类进化分析

作者：王海山; 蒋欢; 陈治; 杨超杰; 叶乐^*

来源：水产学杂志, 2022, 35(02): 14-20.

DOI：10.3969/j.issn.1005-3832.2022.02.003

• 线粒体DNA
• 鲹科鱼类
• 系统进化

用生物信息学方法研究了鲈形目鲹科（Carangidae）鲹亚科、鲳鲹亚科和鰤亚科中33种鱼的线粒体基因组，分别使用ClustalⅩ、MEGAⅩ和DnaSP 5.0软件进行核酸序列比对，碱基组成及核酸多样性分析和构建系统进化树。结果表明：1)33种鲹科鱼类线粒体基因组序列全长为16 530～16 609 bp，总的简约信息位点共6 297个，变异位点共7 072个（占42.0%）；核苷酸组成A+T的含量占53.8%，大于G+C含量，呈AT偏向性；转换/颠换比值（R）1613/1026;2)33种鲹科鱼类种间遗传距离平均值为0.183；种间遗传距离最大值为卵形鲳鲹（Trachinotus ovatus）与高体若鲹（Carangoides equula）间的0.250，最小值为黑纹小条鰤（Seriolina nigrofasciata）与白舌尾甲鲹（Uraspis helvola）间的0.002;3）卵形鲳鲹与鲳鲹属外物种的遗传距离最大，平均值为0.229，泰勃圆鲹（Decapterus tabl）与其他鲹科鱼类平均遗传距离最小为0.170;4）若鲹属的高体若鲹与圆鲹属、竹筴鱼属聚为一支，与同属甲若鲹（Carangoides armatus）和马拉巴若鲹（Carangoides malabaricus）亲缘关系较远。鲳鲹属在进化上与其他鲹科鱼类分化较大，圆鲹属与其他鲹科鱼类遗传距离更近，在线粒体基因组水平上高体若鲹与圆鲹属鱼类亲缘关系更近，与传统分类结果存在差异。

• 单位
  海南热带海洋学院; 宁波大学; 生命学院