基于线粒体基因组的鲹科鱼类进化分析

作者:王海山; 蒋欢; 陈治; 杨超杰; 叶乐*
来源:水产学杂志, 2022, 35(02): 14-20.
DOI:10.3969/j.issn.1005-3832.2022.02.003

摘要

用生物信息学方法研究了鲈形目鲹科(Carangidae)鲹亚科、鲳鲹亚科和鰤亚科中33种鱼的线粒体基因组,分别使用ClustalⅩ、MEGAⅩ和DnaSP 5.0软件进行核酸序列比对,碱基组成及核酸多样性分析和构建系统进化树。结果表明:1)33种鲹科鱼类线粒体基因组序列全长为16 530~16 609 bp,总的简约信息位点共6 297个,变异位点共7 072个(占42.0%);核苷酸组成A+T的含量占53.8%,大于G+C含量,呈AT偏向性;转换/颠换比值(R)1613/1026;2)33种鲹科鱼类种间遗传距离平均值为0.183;种间遗传距离最大值为卵形鲳鲹(Trachinotus ovatus)与高体若鲹(Carangoides equula)间的0.250,最小值为黑纹小条鰤(Seriolina nigrofasciata)与白舌尾甲鲹(Uraspis helvola)间的0.002;3)卵形鲳鲹与鲳鲹属外物种的遗传距离最大,平均值为0.229,泰勃圆鲹(Decapterus tabl)与其他鲹科鱼类平均遗传距离最小为0.170;4)若鲹属的高体若鲹与圆鲹属、竹筴鱼属聚为一支,与同属甲若鲹(Carangoides armatus)和马拉巴若鲹(Carangoides malabaricus)亲缘关系较远。鲳鲹属在进化上与其他鲹科鱼类分化较大,圆鲹属与其他鲹科鱼类遗传距离更近,在线粒体基因组水平上高体若鲹与圆鲹属鱼类亲缘关系更近,与传统分类结果存在差异。

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