摘要

为了分析月季密码子使用偏好性及其成因,对月季1794个注释基因的密码子进行研究,结果表明:月季密码子的平均CAI含量为19%,平均GC3s含量为27.2%,平均ENC含量为52.8%,基因密码子第3位偏好使用A、T碱基,密码子的使用偏好性较弱。ENC-plot和PR2-plot分析表明月季密码子偏好性除了受中性突变影响外,还可能受如选择压力等因素影响。RSCU值分析显示月季37个高表达优越密码子中以A/U结尾的有24个,结合26个高频密码子最终确定18个最优密码子,其中15个以A/U结尾。该结果揭示了月季密码子的使用偏好性,为研究月季密码子的使用模式及月季经济性状的遗传改良提供参考。