猪Nramp1基因及其蛋白生物信息学分析

作者：杨兵; 刘孟学; 赵春芳; 阮崇美; 许金根^*

来源：安徽科技学院学报, 2023, 37(05): 20-25.

DOI：10.19608/j.cnki.1673-8772.2023.0072

• 猪
• Nramp1
• 生物信息学分析

目的:分析猪Nramp1基因序列及其编码蛋白的结构。方法:用生物学软件分析猪Nramp1基因编码区序列，并预测猪Nramp1蛋白的理化性质、信号肽、跨膜结构、二级结构、磷酸化位点、N-糖基化位点、互作蛋白，并分析7个哺乳动物Nramp1蛋白序列的同源性。结果:猪Nramp1基因编码区长1 617碱基对(bp),G-C含量(58.50%)高于A-T含量(41.50%)。猪Nramp1蛋白分子量为58 829.22 u,等电点为8.01,不稳定系数为44.76,平均亲水系数为0.605,氨基酸组成以亮氨酸数量(85个)最多；二级结构主要为α螺旋(占55.58%)和延伸链(占14.13%),没有信号肽，含12个跨膜区，有40个潜在的磷酸化位点、2个N-糖基化位点，与其互作的有TLR4等蛋白。猪Nramp1蛋白序列与水牛、普通牛、山羊、人、小鼠、绵羊的同源性分别为87.2%、88.1%、87.7%、86.8%、84.4%和88.5%。结论:该研究结果为分析猪Nramp1基因及其蛋白的结构和功能提供基础。

• 单位
  安徽科技学院; 动物科学学院