单细胞转录组测序技术发展及其在甘薯中的应用

作者:赵楠; 梁雪莲; 谢淑燕; 张新新; 马婷婷; 邹宏达; 陈景益; 房伯平; 黄立飞
来源:西北农林科技大学学报(自然科学版), 2023, 51(03): 39-50+61.
DOI:10.13207/j.cnki.jnwafu.2023.03.005

摘要

单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)技术是在单个细胞水平通过对mRNA进行高通量测序研究其整体水平基因表达情况的一项新技术。本研究概述了scRNA-seq技术的发展历程和创新;详细介绍了scRNA-seq技术的单细胞捕获/分选、反转录/PCR扩增、建库测序和测序数据基础分析等步骤,以及在植物单细胞图谱、非生物胁迫响应机制、细胞分化发育、转录因子调控网络等研究中的应用;剖析了该技术在甘薯中单细胞图谱、分化、抗逆和基因方面的应用潜力;最后对该技术的应用进行了展望。

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